生命科学公共实验中心新近购置的静电场轨道阱高分辨质谱仪(QE Plus )配备Easy-nLC1200纳升液相,Protein Discovery 软件(高通量蛋白质鉴定软件)。主要用于蛋白质组学研究,包括蛋白质鉴定、翻译后修饰、生物大分子相互作用、多肽和蛋白质定量分析。
一次进样可以同时完成鉴定(Identify)、 定量(Quantify)、确证(Confirm)。
PD是高通量蛋白质鉴定软件,它整合了SEQUEST和Amanda算法,可以解析来自各种裂解技术(CID、HCD、 ETD)的MSn多级数据,配合蛋白质数据库(数据库均可在网上免费下载),可得到样品中蛋白质ID,翻译后修饰位点,肽段序列及序列覆盖度,谱图匹配,鉴定结果可信度打分等信息。具有定量功能组件,还可处理同位素标记的蛋白质组学定量实验包括SILAC标记、iTraq标记和TMT标记,给出不同样本间同一蛋白质的相对定量结果数据。
培训内容:
1. 应用技术:蛋白质鉴定、翻译后修饰、生物大分子相互作用、多肽和蛋白质定量分析。
2. 仪器原理与操作
培训工程师:Thermofisher 应用工程师 周悦